細胞大小與形態量測
設定已知長度與 µm/pixel,以矩形 ROI 取得面積、灰階統計,或以直線工具量測長度。此版沒有單顆細胞自動周長與長軸估算。
核心概念:Pixel-to-µm calibration · ROI
百洑傳息BIOFLUMEN & XENSOR LAB張鈞豪博士 · Dr. Chun-Hao Chang
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MEDTECH VIRTUAL LAB · IMAGE ANALYSIS v0.3
Image Analysis · Microscopy · Quantitative Imaging
第三版在原創瀏覽器影像工作台中新增三種引導式教學練習:比例尺校正、12 顆合成粒子計數,以及目標/背景灰階比較;可保存本機量測紀錄並匯出 CSV。進階 ImageJ 功能仍以外部連結前往 ImJoy 團隊提供的 ImageJ.JS。
本站自製 Web-Image Lab 採原生 JavaScript Canvas,影像在您的瀏覽器中處理,程式未加入影像上傳接口或第三方分析函式庫。完整 ImageJ.JS 由第三方 ImJoy 團隊提供;本網站沒有託管、修改、複製或嵌入 ImageJ.JS、CheerpJ 及其插件。點擊外部連結後會離開本站,資料處理方式依外部服務政策。
本站工作台是教學用的簡易分析原型,支援桌面與觸控操作;瀏覽器差異仍需實機測試。學生量測結果需人工核對,合成基準圖的標準答案僅適用於該固定測試影像。
GETTING STARTED
可先在本站工作台完成基本練習;以下提及的 ImageJ 選單名稱,則對應外部完整版 ImageJ.JS。
點選上方「本站影像分析工作台」進行本機練習;進階功能可另開第三方 ImageJ.JS。
於本站使用「合成細胞示範」或上傳 PNG/JPEG/WebP;外部 ImageJ.JS 可以使用 File → Open。
在本站輸入經確認的 µm/pixel,再拖曳矩形 ROI 或直線;外部 ImageJ 可使用 Analyze → Set Scale。
在本站調整 Threshold 後執行連通區計數,再匯出 CSV/PNG;外部 ImageJ 可使用 Analyze → Measure 或 Analyze Particles。
CLASSROOM EXERCISES
設定已知長度與 µm/pixel,以矩形 ROI 取得面積、灰階統計,或以直線工具量測長度。此版沒有單顆細胞自動周長與長軸估算。
核心概念:Pixel-to-µm calibration · ROI
利用 12 顆合成圓形基準圖調整 Threshold 與最小面積,觀察連通區數量與參數的關係。
核心概念:Segmentation · Size filtering
分別擷取目標及背景 ROI 的平均灰階,計算兩者差值,討論曝光與背景的影響。
核心概念:Mean gray value · Background
PRIVACY & ATTRIBUTION
ImageJ.JS 由 ImJoy Team 開發。本站自製工作台採原生瀏覽器程式碼;ImageJ.JS 部分僅提供名稱介紹、教學導引與對外連結,未使用對方的程式碼、商標圖像或截圖,也未表示雙方具有合作或官方認證關係。
建議引用:Ouyang W, Mueller F, Hjelmare M, et al. ImJoy: an open-source computational platform for the deep learning era. Nature Methods (2019). DOI: 10.1038/s41592-019-0627-0.
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